環境保護涉及到水、大氣、土壤等多個方面污染防治，與許多部門息息相關。形成一個國家層面的生態環境保護信息化工程，就意味著它不是純環保項目，而是一個環保和其他部委共同協作、共享共建的項目。
        比如對于違法企業和掛牌督辦的企業，以及產業落后和產能過剩企業，在嚴把項目準入關方面，就要共享發改委、工信部等部門的信息。假設有一個環境違法管理系統，關聯一個違法數據庫、一個企業信用等級評價管理系統和企業評價數據庫，系統可能是環保部門負責的，也可能是執法部門負責的。如果執法部門發現企業是惡意偷排，就將其錄入到違法數據庫，這就觸發了企業信用等級評價管理系統。按照企業等級評價的管理辦法，只要是惡意偷排的企業就一票否決，將他歸入不誠信企業，這就是互聯互通。信息共享不僅僅是把你的信息給我，把我的信息給你，也不僅僅是搭建一個平臺，大家都把信息放上去。信息共享一定要跟業務協同、跟信息的互聯互通連在一起。
     “十二五”國家政務信息化工程建設目標和要求非常高，環境保護信息化基礎薄弱，要實現這些目標，達到這些要求難度很大。生態環境概念大，涉及內容多，解決生態環境突出問題是一個長期的系統工程，工程項目的重點和切入點難以把握，工程建設的內容、范圍和邊界都難以確定。打破部門之間的界線，讓業務協同起來，互通起來，這才叫互聯互通，而不是簡單地放在一起。
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