中小企業創造的價值占中國國內生產總值比重超過50%，提供的出口占60%，上繳的稅收占43%，并提供了75%的城鎮就業機會，是中國吸納就業人口的主要場所，也是地方財政的主要來源。如煤炭、冶金、電力、建材、焦化是中國山西省的支柱產業，其中僅煤炭工業的產值和上繳利稅即占全省工業總產值和上繳利稅的37%，農民人均收入的1/6源于煤炭。1999年國家環保局對該省許多污染企業進行了清理整頓，并關閉了嚴重污染的企業，這使得山西省當年經濟增長降低了5個百分點。2000年上半年，因關閉“五小”該省減少產值約67億元人民幣，減少利稅5.6億元人民幣。
        據東莞粉塵治理專家調查發現出于對地方經濟利益的考慮，許多地方政府對中小企業的污染往往是“睜一只眼，閉一只眼”，默許其存在。一些地方領導會保護這些企業不被查處。而嚴重的地方保護主義導致更多企業不顧環保違法生產。
        與此同時，在中國治污設施建設和運行成本過高，而企業超標排污受到的處罰大大低于達標排污成本，使的企業不愿治理污染。中國大多數中小企業，由于規模和技術限制等因素，污染治理成本遠高于其可能獲得的經濟效益。以污水處理為例，造紙行業一套日處理能力為150噸的堿回收工程需投資近億元，占企業環保總資產近1/2，運行費用可占其銷售總收入的10%以上。而由于中國排污收費的征收標準偏低，非法排污行政處罰力度不夠，偷排每日的凈收益往往能達到幾十萬元，環保部門最高罰款限額僅為10萬元，因此，一些企業寧愿認罰也不積極采取措施防治污染。
       由于經濟利益的驅動和地方保護主義的影響，雖然中央環保部門對一些環境污染問題十分突出的地區多次督辦，卻見不到成效。
為了打擊這種關閉企業重新生產的現象，國家環境保護總局以今年環境污染清理整頓為開端，將用3年時間深入、持久地開展嚴查環境違法行動，重點查處違反環境管理規定開工的建設項目，以及未按國家規定期限淘汰的落后企業，要公開處理一批典型違法案件，嚴肅查處當地政府及有關部門的行政不作為行為。中小企業對地方經濟發展和就業起著不可替代的作用，但絕不能以破壞環境和浪費資源為代價。
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