設項目環境評價是對擬建項目環境系統狀況的價值評定、判斷和提出對策。結合國務院提出的減少審批事項、下放審批權限、提高審批效率的要求，建設項目環境影響評價管理也急需進行改進和完善。專家認為，應做好以下工作：
1、明確自身權責，擯棄本應由綜合管理部門審核的內容，加強環境準入控制。根據國家發展和改革委員會2004年頒布的《企業投資項目核準暫行辦法》，環保部門其實只需對資源利用及生態環境影響分析相關內容負責。對于建設項目是否符合產業政策和發展規劃，應由綜合管理部門最終認定。東莞環評專家介紹特別是對于化工、冶金等產品、工藝復雜的行業，環保部門很難判斷其是否符合產業政策，在實踐中也出現過環保部門認為某項目不符合產業政策，而投資主管部門卻持相反意見的情況。此外，對于《產業結構調整指導目錄》中的限制類產業，事實上屬于準入控制的模糊地帶，只有綜合管理部門才有權界定其是否符合產業政策。基于此，建設項目環境影響評價中的準入控制應重點關注擬建項目是否符合與環境管理直接相關的主體功能區規劃、生態功能區劃、環境功能區劃及國家環境保護政策、標準等。
2、突出特色，增強環境影響評價預測的專業性。作為預斷性評價，項目建成后可能對環境造成的影響預測、分析和評估，是建設項目環境影響評價的核心內容，也是最終投資管理部門的決策依據。對此，除了進一步做實傳統的大氣影響評價、水環境影響評價、生態影響評價、聲環境影響評價、環境風險評價等工作外，還應緊跟當前的環境保護形勢，加強氣候變化、生物多樣性、重金屬污染、人體健康等方面的評價內容。在做好預測評價的基礎上，從社會—經濟—環境大系統出發，做好環境保護措施的技術經濟論證和環境經濟損益分析，切不可就環保論環保。
3、改進管理體制，厘清與其他專業管理部門之間的關系。中央政府已經提出，要從改革行政審批制度入手來轉變政府職能，并把取消和下放審批事項作為重點。環境保護管理部門也應根據國務院要求，盡快理順與其他業務主管部門之間的關系，進一步做好相關工作。當前，在管理中不應再將國土、水利、城建等部門對擬建項目的意見作為環評審批的前置條件，在建設項目環評文件中也應淡化此類內容。同時，應把工作重點放到相應的環境影響分析論證和環境保護措施上去。
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