我國20多年前就已開始對排污許可證管理制度的探索，而且國內多個省市也建立了排污許可證制度，但因形式大于內容，操作過于簡單化，不夠精細，最后只成為一張紙。那么如何真正建立起現代排污許可證制度？
1、要從國家層面對排污許可證制度進行梳理，系統研究現在排污許可證制度執行的現狀，找出問題和不足。通過許可證把環境像資源一樣精細化管理起來，從前期到中間再到末端、企業產生到成長再到消亡，進行生命周期管理。東莞環保專家提醒做好制度的框架設計很關鍵，要抓好兩件事：一是要研究針對固定源建立以許可證為核心的體系以及許可證的詳細設計，不要等到條例出臺以后才去做這事兒。二是要推動不同介質分開，體現精細化管理，管好、管嚴、管出成效應是我們努力的方向。
2、要改變觀念。實現條理化管理，許可證是一個很好的切入點和環境管理主線。政府部門需要從公共產品和環境質量的高度去認識制度的重要性，堅定信心去推這項制度；環保部門要做好積極準備，一是技術準備，二是從思想上真正把排污許可證作為環境管理的核心制度來建立；企業層面要提高認知度，許可證制度絕對不是再給企業增加枷鎖，而是企業守法排污的法律證據。
3、對于許可證制度的執行，各級權限要清楚。國家主要負責制定規則，省一級則監督執行，許可的執行應該在市一級，體現權利和義務的統一。如果責權不清，就很容易亂。我認為有必要建立單獨的排污許可證管理部門，包括監督管理和統籌協調都要有專門機構。
      從具體實踐看，建議先實行試點示范，鼓勵一些地方按照現代許可證制度先管起來。這既是對原來流于形式的制度的修正，也是制度創新。同時也要思考如何合理面對我國現在機制上的障礙，實現制度之間的配合。
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