化學制藥廢水成分復雜、有機物含量高、毒性大、色度深和含鹽量高，特別是生化性很差，且間歇排放，屬難處理的工業廢水。隨著我國醫藥工業的發展，制藥廢水已逐漸成為重要的污染源之一。在生物處理前必須先進行預處理，達到排除生物毒性物質干擾，降低廢水濃度的目的。據東莞廢水處理廠介紹目前合成制藥廢水生化前預處理方法主要包括：物化法、生物法等。 
一、物化法            
1、電解法　如在甲紅霉素廢水中加入NaCl電解質，電解陽極間接氧化法的處理效果。電解產物NaClO具有極強的氧化性，當進水COD為331630mg/L時，其COD去除率可達46.1%，但所需電解時間相對較長。     
2、微電解法　如采用鐵屑-活性炭內點解法預處理大連某制藥廠廢水，COD去除率達到了23.38%，B/C由0.1提升至0.31。   
3、膜分離法膜技術　如用NF-90納濾膜處理水楊酸廢水，COD為4000-5000mg/L，去除率高達80%以上。利用該項技術對抗生素廢水進行濃縮分離，有良好的經濟效益和社會效益。
4、混凝法　化學制藥廢水成分復雜，沖擊負荷大，采用化學絮凝進行預處理，以便減少生物毒性物質干擾，降低廢水濃度。利用混凝沉淀方法去除混合液中的有機物及部分非溶解態的溶媒物質具有較好的效果，COD由4080mg/L降低至2774mg/L，平均去除率達到32.0%。但是，混凝法容易產生二次污染。        
5、Fenton氧化技術　Fenton氧化技術是高級氧化技術中的一種，與其他高級氧化技術相比，Fenton氧化技術具有快速高效、可產生絮凝、設備簡單、成本低、技術要求不高等優點。
二、生物法             
目前生物法預處理化學制藥廢水主要采用水解酸化。其原理是在廢水處理中，利用水解酸化來提高廢水的可生化性，也為廢水的后期處理創造良好的條件。對于含有難降解物質較高的制藥廢水，水解酸化的重要作用已經逐漸得到人們的認可，水解酸化的相關研究也成為國內外的研究熱點。
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